Každý, i nově instalovaný otopný systém, obsahuje látky, které ohrožují jednotlivé prvky otopného systému, zejména kotle. Může to být olej používaný při lisování plechových radiátorů, zbytky těsnících hmot, pájky a podobně. Ve starších systémech bývají usazeniny, produkty koroze, vodní kámen a další látky, které se při provozu usazují v kotli a mohou i v krátké době způsobit jeho selhání. Kromě chemického ošetření otopné soustavy doporučujeme otopný systém osadit speciálními filtry pro průběžné odstraňování nečistot a usazenin ze systému.
Předejít problémům způsobeným špatnou kvalitou vody v otopném systému umožňují čistící a ochranné přípravky pro otopné systémy. Otopný systém je třeba nejprve vyčistit pomocí čisticích prostředků a odstranit tak z něj potenciálně nebezpečné látky. Poté se aplikuje ochranný prostředek, který upravuje kvalitu vody v systému a zabraňuje vzniku koroze či usazenin.